Le nom de Pfastatt vient du vieux haut allemand Pfaffenstat, qui signifie littéralement lieu des prêtres, un nom que connaissent bien les pompes funèbres Pfastatt. Cette origine remonte à l'époque mérovingienne, quand un domaine religieux s'installa sur ce territoire, rattaché dès 728 aux biens de l'abbaye de Murbach.
Un château, aujourd'hui disparu, appartint dès 1301 à la famille noble des Hauss, avant de changer plusieurs fois de mains au fil des siècles. Il fut finalement détruit lors de la guerre de Trente Ans, entre 1618 et 1648.
La commune est aujourd'hui marquée par un autre passé, industriel celui-là : une tuilerie puis une manufacture d'impression sur étoffes s'y installèrent dès le XVIIIe siècle.
Cette double identité, entre racines religieuses médiévales et essor industriel, façonne encore le rapport des Pfastattois à leur ville, aux portes de Mulhouse.